可粗略的分為限制酶,連接酶,聚合酶和修飾酶四大類。其中,以限制性核酸內(nèi)切酶和DNA連接酶在分子克隆中的作用突出。
1、限制酶:
生物體內(nèi)能識別并切割特異的雙鏈DNA序列的一種內(nèi)切核酸酶。它可以將外來的DNA切斷的酶,即能夠限制異源DNA的侵入并使之失去活力,但對自己的DNA卻無損害作用,這樣可以保護(hù)細(xì)胞原有的遺傳信息。由于這種切割作用是在DNA分子內(nèi)部進(jìn)行的,故名限制性內(nèi)切酶(簡稱限制酶)
2、連接酶:
它是一種封閉DNA鏈上缺口酶,借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA鏈的5'-PO4與另一DNA鏈的3'-OH生成磷酸二酯鍵。但這兩條鏈必須是與同一條互補鏈配對結(jié)合的(T4DNA連接酶除外),而且必須是兩條緊鄰DNA鏈才能被DNA連接酶催化成磷酸二酯鍵。 連接酶有T4噬菌體DNA連接酶、T4噬菌體RNA連接酶、大腸埃希菌DNA連接酶等。DNA連接酶可連接平端,也連接粘端。
3、聚合酶:
又稱DNA聚合酶。系專司生物催化合成脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)的一類酶的統(tǒng)稱。
4、核酸酶:
核酸酶有DNase、RNase、核酸酶S1等,可水解相應(yīng)的DNA和RNA,核酸酶S1可降解單鏈DNA和RNA,用量增大也可降解雙鏈核酸。它可用于切去ds-cDNA合成中產(chǎn)生的發(fā)夾環(huán)。
5、修飾酶:
體內(nèi)有些酶可在其他酶的作用下,將酶的結(jié)構(gòu)進(jìn)行共價修飾,使該酶活性發(fā)生改變,這種調(diào)節(jié)稱為共價修飾調(diào)節(jié)(covalent modification regulation),這類酶稱為修飾酶(prosessing enzyme)。